Главная
Вычислительные ресурсы
C чего начать
Вопросы - ответы
Документация
Исследования
Контакты

Вычислительная система МВС – экспресс.
SKIF-MPI - реализация MPI на машине МВС – экспресс.
Руководство пользователя.

Климов Ю. А., Лацис А. О.

Введение.

Руководство пользователя.

Для использования MPI следует включить в путь (в файле ~/.profile) директорию /common/skif-mpi/bin после /common/runmvs/bin.

Трансляция программы.

Программа пользователя транслируется командой mpicc, например:

mpicc -o myprog myprog.c

Программа на C должна иметь тип исходного файла «.c», и включать файл заголовков «mpi.h».

Если программа написана с использованием OpenMP, то соответствующий аргумент следует добавить к команде трансляции, например:

mpicc –o myprog -openmp myprog.c 

Запуск программы.

Программа пользователя запускается командой mpirun с ключом -ppn X, где X – число процессов, запускаемых на одном узле вычислителя. Допустимые значения X – от 1 до 7 (число доступных программе пользователя процессоров на узле). Процессы раскладываются по узлам по X штук в порядке номеров. Например, при использовании команды mpirun -ppn 3  на первом из выделенных программе узлов будут размещены процессы 0, 1 и 2, на втором – 3, 4 и 5, и т. д. Аргументы этой команды – как у mpirun, например:

mpirun -ppn 7 -np 24 -maxtime 5 myprog
- запуск программы myprog на 5 минут на 24 процессорах. При этом на первых 3-х узлах будет задействован 3*7=21 процессор, а на 4-м узле - оставшиеся 3 процессора.

В состав узла входит, помимо семи процессоров, лишь один ускоритель CUDA. Если предполагается, что каждый процесс программы использует CUDA  независимо от других, то такую программу можно запускать только в режиме «один процесс на узел» (mpirun -ppn 1).

В этом же режиме следует запускать программы, написанные с использованием OpenMP. При этом следует явно указывать число процессов на узле равным 7, например:

#pragma omp parallel for schedule(static) num_threads(7)

Прочие действия пользователя по управлению прохождением программ.

На МВС-экспресс устанавливается та же система управления прохождением задач, что используется для кластерных версий МВС-1000. Различия описаны выше в настоящем документе. Все остальные сведения можно почерпнуть, например, из: www.kiam.ru/MVS/documents, «Руководство пользователя системы МВС-1000», вариант для машин «rsc2» или «rsc4».

 
 
 
 
 
 
 
  Тел. +7(499)220-79-72; E-mail: inform@kiam.ru